|
|
Hardwarová akcelerace algoritmu pro hledání podobnosti dvou DNA řetězců
Nosek, Ondřej ; Kořenek, Jan (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Metody pro zarovnání různých typů bioinformatických sekvencí jsou klíčovou součástí výzkumu v této oblasti. Úlohy jsou časově velmi náročné, a proto má smysl vytvořit hardwarovou platformu pro urychlení těchto výpoětů. Cílem této práce je navržení obecné architektury založené na FPGA technologii, která dokáže pracovat s několika různými druhy sekvencí. Metody, které bude navržená akcelerační karta používat budou především dynamické algoritmy Needleman-Wunsch a Smith-Waterman.
|
|
|
Analýza GPS dat v orientačních sportech
Picek, Štěpán ; Gregor, Petr (vedoucí práce) ; Kučera, Petr (oponent)
V orientačních sportech nalezneme mnoho analytických nástrojů pro zjišťo- vání výkonnosti závodníků a vizualizaci tras. Žádný z těchto nástrojů však ne- poskytuje automatické porovnávání a následnou analýzu proběhnutých postupů závodníků mezi jednotlivými kontrolami. Cílem této práce je využití Needleman- Wunschova bioinformatického algoritmu pro porovnávání GPS dat a jejich vizua- lizaci v rámci webové aplikace. Aplikace poskytuje uživatelům nejen porovnávání svých postupů s ostatními uživateli, ale i analýzu výkonnosti a propojení s dalšími nástroji. Postavena je na platformě ASP.NET Core a návrhovém vzoru Model- View-Controller s použitím dalších technologií jako HTML, CSS a TypeScript.
|
|
|
Určování genetické odlišnosti biologických sekvencí DNA
Sliž, Ladislav ; Škutková, Helena (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Práce na téma určování genetické odlišnosti zarovnáváním signálu biologických sekvencí DNA, se bude zabývat stručným popisem skladby DNA. Následovat bude základní informace o bioinformatické analýze. Poté bude práce popisovat možnosti zarovnávání sekvencí DNA. Práce se zaměří především na globální Needlemanův-Wunschův algoritmus a lokální Smit – Watermanovův algoritmus. Dále se tato práce zaměří na zarovnávání DNA sekvencí pomocí metod CGR a FCGR. Na závěr bude práce popisovat praktickou aplikaci určování genetické odlišnosti pomocí zarovnávání sekvencí
|
|
|
Hardwarová akcelerace algoritmu pro hledání podobnosti dvou DNA řetězců
Nosek, Ondřej ; Kořenek, Jan (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Metody pro zarovnání různých typů bioinformatických sekvencí jsou klíčovou součástí výzkumu v této oblasti. Úlohy jsou časově velmi náročné, a proto má smysl vytvořit hardwarovou platformu pro urychlení těchto výpoětů. Cílem této práce je navržení obecné architektury založené na FPGA technologii, která dokáže pracovat s několika různými druhy sekvencí. Metody, které bude navržená akcelerační karta používat budou především dynamické algoritmy Needleman-Wunsch a Smith-Waterman.
|
host ::
RSS.